在食品加工车间选用的是将臭氧产生器立即释放出来到空气中的方式，使全部室内空间及该室内空间中物件的周边充斥着臭氧汽体，在臭氧强化学作用下，做到消毒杀菌的目地。在加工车间应用臭氧的一个关键难题是明确逐渐提供杀菌的目地。
在加工车间应用时加工车间内的病菌处在最少情况。一般可供车间臭氧1-2钟头，封闭式溶解1钟头，那样即做到杀菌、消毒的实际效果，又使工作的职工嗅不上显著的臭氧味。若因必须非要在有些人的自然环境下开展消毒工艺流程时，则应在车间的部分密封性房间内开展。